郑州果树研究所成立于1962年，是中国农业科学院果树研究所的附属机构。其前身为河南省林科院果树与蚕桑研究室，随着河南省果树事业的不断发展，于1992年升格为郑州果树研究所。目前，该研究所拥有综合研究部、果树栽培部、果树生理生化部、果树遗传育种部、果树病虫害防治部、果品加工部等多个研究部门。
郑州果树研究所主要研究果树的种质资源及其遗传育种、果树生理生态、栽培技术、病虫害防治、果品加工等多个方面。在果树种质资源的收集、鉴定、筛选和利用方面取得了显著的成果，培育了丰富多样的果树新品种；在优良果品的品质特性及营养物质分析方面取得了突破；在果树病虫害的诊断与治疗方面也有较深入的研究，尤其是在病虫害生态防治方面有着丰富的实践经验。
近年来，郑州果树研究所在果树遗传育种方面推出了多个国家级品种，如达乌里山楂、黑核果黄桃、水晶冰糖梨、金秋西瓜等；在果树生理生态方面，初步揭示了氮素吸收利用规律及甲烷排放特点等；在病虫害防治方面，建立了核桃细孔螟防治新模式，并在南方柑桔的病害诊断及治疗方面增加了新的手段。此外，该所还在果品加工、生态环境优化等方面也有着多项研究成果。
郑州果树研究所积极开展国际合作，建立了多个技术合作与联合研发平台，与美国、德国、法国、澳大利亚、日本、韩国、新加坡等国家和地区的科研机构进行了广泛高效的交流合作。同时，该所还组织了多次国际、国内重要学术会议，增进了同行之间的互动与合作。
未来，郑州果树研究所将继续致力于果树科学技术研究，进一步加强国内外的学术交流与合作，共同推动我国果树事业的发展。同时，该所还将加强团队建设，提高人才培养质量，打造一支高素质的研究团队，积极参与国内外主要科技项目，进一步提升自身的科研实力和综合竞争力。
